單細胞測序相關研究與日俱增。該技術已廣泛應用于科研行業(yè)神經生物學、種系傳播、器官生長、癌癥生物學等多個領域的研究。
單細胞測序技術是指在單個細胞水平上,對基因組、轉錄組、表觀組進行高通量測序分析的一項技術。它能夠揭示單個細胞的基因結構和基因表達狀態(tài),反映細胞間的異質性,在腫瘤、發(fā)育生物學、微生物學、神經科學等領域發(fā)揮重要作用,正成為生命科學研究的焦點。
以前,需要從大量細胞中獲取足夠多的DNA進行測序,因此測序結果是這些細胞"整體"的表征。然而,由于細胞異質性,相同表型的細胞的遺傳信息可能存在顯著性差異,很多低豐度的信息會在整體表征中丟失。為了彌補傳統高通量測序的局限性,單細胞測序技術應運而生。
單細胞測序相關研究與日俱增。該技術已廣泛應用于科研行業(yè)神經生物學、種系傳播、器官生長、癌癥生物學等多個領域的研究。
近日,騰訊研究成果登《Nature》子刊:「scBERT」模型攻克單細胞測序數據分析痛點。
騰訊在論文中創(chuàng)新性地提出關于單細胞注釋的“scBERT”算法模型,受到《Nature Machine Intelligence》雜志評審高度認可,表示該成果對于單細胞轉錄組測序數據分析領域未來研究具有深遠意義。
單細胞測序技術是生命科學領域的一項革命性技術,可以細粒度地觀察和刻畫各個物種中組織、器官和有機體中單細胞分子圖譜(細胞表達),便于更好地了解腫瘤微環(huán)境,以達到精細分析病因、精準匹配治療方案的效果,對于“精準醫(yī)療”具有極高的應用價值。
值得注意的是,受數據樣本量小、人工干預多、過度依賴marker gene(已報道的特異性基因)等因素的影響,單細胞測序細胞類型注釋技術一直面臨著泛化性、可解釋性、穩(wěn)定性均比較低的問題,現存的算法難以有更廣泛的應用。
針對以上問題,論文中首次提出“基于大規(guī)模預訓練語言模型的單細胞轉錄組細胞類型注釋算法”,即“scBERT”模型,首次將“transformer”(自然語言處理算法經典計算單元)運用到單細胞轉錄組測序數據分析領域。
根據中研普華研究院《2022-2027年全球及中國單細胞測序行業(yè)發(fā)展調研及投資前景分析報告》顯示:
2019年9月,美國單細胞測序公司10x Genomics在納斯達克上市,IPO3.9億美元,成為該領域的領頭羊。國內單細胞測序行業(yè)發(fā)展較為滯后,但也頗受資本青睞。2019年3月,萬乘基因完成五百萬元天使輪融資;6月,百奧智匯完成A輪融資,新格元生物完成近億元pre-A輪融資;10月,尋因生物完成數千萬元pre-A輪融資。
單細胞測序即從單個細胞水平上對基因組進行測序,把基因測序應用到單個細胞層面,從而識別細胞的類型、功能,特定細胞健康或狀態(tài)的變化、變異。而常規(guī)的基于NGS的基因檢測,都是在大量細胞宏觀水平上,對整個細胞群進行遺傳分析。
在基因層面,單細胞測序可以獲取更精準的遺傳信息,在蛋白層面,通過分析單細胞表達的蛋白可以直接的獲取人體免疫相關的靶點,用于免疫診斷、新藥研發(fā)等。鑒于蛋白質不具有直接擴增的特性,以及蛋白質組學分析靈敏度的限制,單細胞蛋白分析的常見、有效技術是質譜分析,主要技術包括質譜流式細胞術(Mass Cytometry)、TOF-SIMS(飛行時間二次離子質譜儀)分析等。
質譜流式技術平臺最初由美國DVS Science開發(fā),但這家企業(yè)于2014年被美國Fluidigm以2.1億美元收購。國內單細胞蛋白分析的代表企業(yè)為宸安生物、普羅亭,其中,宸安生物專注單細胞質譜流式診斷設備、試劑和軟件開發(fā),普羅亭致力于以單細胞蛋白層面研究為核心的檢測服務。
無論是基因層面,還是蛋白層面,單細胞分析技術已然成熟,但囿于成本并未廣泛應用于市場上,更多的是為科研提供服務。動脈網整理了全球單細胞行業(yè)的目前發(fā)展狀況,以及單細胞技術在贏來大規(guī)模應用之前面臨的挑戰(zhàn)與機遇。
隨著單細胞測序行業(yè)競爭的不斷加劇,大型企業(yè)間并購整合與資本運作日趨頻繁,國內外優(yōu)秀的單細胞測序企業(yè)愈來愈重視對行業(yè)市場的分析研究,特別是對當前市場環(huán)境和客戶需求趨勢變化的深入研究,以期提前占領市場,取得先發(fā)優(yōu)勢。
《2022-2027年全球及中國單細胞測序行業(yè)發(fā)展調研及投資前景分析報告》由中研普華研究院撰寫,本報告對該行業(yè)的供需狀況、發(fā)展現狀、行業(yè)發(fā)展變化等進行了分析,重點分析了行業(yè)的發(fā)展現狀、如何面對行業(yè)的發(fā)展挑戰(zhàn)、行業(yè)的發(fā)展建議、行業(yè)競爭力,以及行業(yè)的投資分析和趨勢預測等等。報告還綜合了行業(yè)的整體發(fā)展動態(tài),對行業(yè)在產品方面提供了參考建議和具體解決辦法。
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2022-2027年全球及中國單細胞測序行業(yè)發(fā)展調研及投資前景分析報告
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